もし同じ体験した方がいたら教えてほしいんですが

199床規模の病院に正職員で入職しました。以前の病院で医師からのパワハラで適応障害と診断され辞めた経緯があります。今回の職場にも事前にその事は話してから入職してます。
最初は順調でしたが徐々に体調を崩し診断書が出て休職になってしまいました。その間上司には受診の度に体調の報告をおこなっていました。3ヶ月ぐらいして体調も良くなり医師からも徐々に仕事に戻ってもいいかもしれないと言われていました。それから少ししてから看護部長から急に「就業規則で休職期間満了で自然退職になる」と言われました。休職は法律にもないことは分かっていますし期間も就業規則で決まっているのは分かります。ただ休職に入る前に休職に関する就業規則を確認しても教えてはくれませんでした。部長から出てきた言葉は「就業規則はその都度説明するものでもないしね」でした。規則の期間、産業医は居るのかいないのか分からないし面談も一度もなし、復職の診断書（時短から開始の条件付き）がでたのも人事から電話一本で正職員に戻れなければダメですねで終わり。
体調を崩して休むことになって職場に迷惑をかけたこともありますが対応が適当すぎないかなと…労基の相談窓口に話したら「対応的にはずさんです」と言われました。病院と争うとかはする気はないですが、自己都合退職にされたらハローワークへ行って証拠や録音は提出していいかもと言われたのでそうするつもりですが、なんだか病院に逆恨みされそうでと考えたりします。もし今まで会社都合（不当解雇）などで辞められた方がいたら無理にとは言いませんがわかる範囲で教えていただければと思います。